金融期货与商品期货从交易机制和交易方式上来看大体上是相同的，但两者在标的物上和交割方式上是不同的。
金融期货的标的物是无形的金融工具或金融产品，而商品期货的标的物是有形的实物商品。
金融期货的交割一般以货币来实现，而商品期货的交割以实物商品来实现。
另外两者区别还在于体现在持有成本，即将期货的标的物持有至期货契约期满所需的成本费用，这成本费用包括三项：
1、储存成本：包括存放标的物及保险等费用；
2、运输成本；
3、融资成本：购买标的物资金的机会成本。
各种商品需要储藏所存放，需要仓储费用，金融期货的标的物，无论市是债券、股票或外币，所需的储存费用较敌低，有些如股票指数期货则甚至不需储藏费用。除此之外，这些金融期货的标的物不但仓储费用低，若存放到金融机构尚能生息，例如股票有股利，债券与外币均有利息，有时这些生息反而超过存放成本，而产生持有利益。一般商品较金融商品另一项较大的费用是运输费用，显然较外币或债券的汇费要高，有些如股价指数甚至是不用运费的。